В 1959 году Дж. Кистяковский был назначен специальным советником президента Д.Д. Эйзенхауэра по научным вопросам и занимал эту должность до начала 1961 года. В высших государственных сферах знали про русское происхождение Джорджа и спокойно воспринимали его иностранный акцент, поскольку его порядочность и громадный научный авторитет не вызывали сомнений. Кистяковский на этом посту в полной мере осознавал, к каким последствиям могут привести ошибочные решения в вопросах производства и использования ядерного вооружения, и имел достаточно смелости, чтобы открыто выражать свою позицию по этим важнейшим вопросам.
Работая в Белом доме, он постоянно вел дневники, в которых пунктуально фиксировал, какие вопросы ежедневно обсуждались с президентом и другими высокопоставленными лицами американской администрации. Впоследствии эти дневники Кистяковского были опубликованы в виде книги. Они стали уникальным источником информации о том, как формировалась внешнеполитическая доктрина США в эти годы, как принимались решения в сфере обороны, в области развития американской науки и техники в условиях противостояния с Советским Союзом.
В 1968 году в знак протеста против войны во Вьетнаме Кистяковский принял решение уйти со всех государственных постов. С этого времени он стал одним из наиболее авторитетных и последовательных борцов за ограничение гонки вооружений и проведение согласованной политики по разоружению совместными усилиями Советского Союза и США. В своих многочисленных статьях в прессе и публичных выступлениях он аргументированно критиковал американскую администрацию за постоянное увеличение военных расходов. Кистяковский доказывал, что после окончания Второй мировой войны настала новая эпоха в развитии науки, что система международных отношений должна основываться на новых принципах, которые будут учитывать разрушительные последствия использования научных достижений в военных целях. По его мнению, ученые должны были менять свое отношение к исследовательской деятельности: им следовало бы руководствоваться осознанием того, что наука и техника должны служить достижению гуманистических целей, а не работать на уничтожение земной цивилизации.
Джордж Кистяковский умер от рака 7 декабря 1982 года в Кембридже, штат Массачусетс.
Александр Клейтман